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相關(guān)服務(wù)
載體構(gòu)建 
質(zhì)粒DNA制備 
病毒包裝服務(wù) 
mRNA基因遞送解決方案 
CRISPR基因編輯解決方案 
shRNA基因敲低解決方案 

線蟲(chóng)gRNA表達(dá)載體

概述

CRISPR/Cas9(成簇規(guī)則間隔短回文重復(fù)序列/CRISPR相關(guān)蛋白9)系統(tǒng)極大地促進(jìn)了多種物種的體外和體內(nèi)基因抑制實(shí)驗(yàn)。在細(xì)胞內(nèi),Cas9核酸酶與引導(dǎo)RNA(gRNA)形成復(fù)合物,該復(fù)合物通過(guò)與基因組中的18-22 nt的同源靶序列直接相互作用提供靶向特異性。gRNA與靶位點(diǎn)通過(guò)互補(bǔ)配對(duì)使Cas9定位到靶序列上,然后切割基因組中的靶位點(diǎn)。Cas9掃描基因組并切割與gRNA互補(bǔ)的序列,前提是這些序列跟隨著一段NGG前間區(qū)序列鄰近基序(PAM)。雙鏈DNA斷裂隨后被HDR或者NHEJ途徑修復(fù),從而產(chǎn)生不同大小長(zhǎng)度的位點(diǎn)突變(堿基插入或缺失)。

使用一個(gè)一體化的同時(shí)表達(dá)Cas9和gRNA的載體,或者分開(kāi)表達(dá)Cas9和gRNA的載體,可以方便地在線蟲(chóng)中進(jìn)行CRISPR/Cas9編輯。該載體系統(tǒng)屬于后者,包含一個(gè)線蟲(chóng)密碼子優(yōu)化的U6啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)表達(dá)的gRNA。該載體可以被注射到線蟲(chóng)的遠(yuǎn)端性腺,然后進(jìn)入生殖細(xì)胞細(xì)胞核。使用該載體注射的線蟲(chóng)可以表達(dá)Cas9。篩選突變后代,獲得突變可遺傳的基因敲除線蟲(chóng)品系。

關(guān)于該載體系統(tǒng)的更新信息,請(qǐng)參考以下文獻(xiàn)。

參考文獻(xiàn)主題
Genetics. 202:885 (2016)DNA transformation in C. elegans
Curr Protoc Mol Biol. 129 (2019)CRISPR/Cas9 vectors in C. elegans
Nat Methods. 10:741 (2013)gRNA design for C. elegans
亮點(diǎn)

通過(guò)在載體骨架上整合進(jìn)人工合成的啟動(dòng)子近側(cè)內(nèi)含子序列,我們的載體經(jīng)過(guò)優(yōu)化可以在線蟲(chóng)中高效表達(dá)轉(zhuǎn)基因。

優(yōu)勢(shì)

技術(shù)簡(jiǎn)單:使用顯微注射即可把質(zhì)粒轉(zhuǎn)入細(xì)胞,相比起病毒載體需要進(jìn)行病毒包裝,過(guò)程更簡(jiǎn)單。.

靈活性:根據(jù)使用者的實(shí)驗(yàn)需求,我們的線蟲(chóng)gRNA表達(dá)載體可以搭配不同類型的Cas9使用。

不足之處

基因拷貝數(shù)在不同細(xì)胞中呈現(xiàn)差異性:盡管成功的轉(zhuǎn)染可以在單個(gè)細(xì)胞里產(chǎn)生非常高的拷貝數(shù),但不同細(xì)胞間卻有高度的差異性。在一些細(xì)胞中,質(zhì)??截悢?shù)非常高,而在另外一些細(xì)胞卻是低拷貝甚至沒(méi)有。

PAM要求:CRISPR/Cas9靶位點(diǎn)必須包含NGG序列(使用較多),也叫做PAM序列,位于gRNA識(shí)別序列3'末端。 

關(guān)鍵元件

CeU6: C. elegans U6 small nuclear RNA promoter. It drives strong expression levels of small RNAs.

gRNA: Guide RNA compatible with the Cas9 variant being used.

Terminator: Pol lll transcription terminator. It allows transcription termination of small RNA transcribed by Pol lll RNA polymerase.

Ampicillin:  Ampicillin resistance gene. It allows the plasmid to be maintained by ampicillin selection in E. coli.

pUC ori:   pUC origin of replication. Plasmids carrying this origin exist in high copy numbers in E. coli.

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